有没有批量提取DNA的简便方法?

求大批量提取dna的简便方法,最近实验室要对转基因的材料进行pcr检测,估计要提取数以千计的水稻叶片dna。实验室一直用ctab法。因为只用于pcr检测,dna的量和质量要求都不高,请问各位同学有没有简便快捷的提dna方法?
pcr的时候误加了pbs有影响吗?


提供一个方法,我最近一直用这个方法提取拟南芥dna用于pcr,效果很好,方便快捷。见文献
a simple and rapid method for the preparation of plant genomic dna for pcr analysis
k.edwards, c.johnstone and c.thompson
nucleic acids research, vol. 19, no. 6 1349




实验室提拟南芥dna,edards溶液简易法用机器震荡完成,如果熟练加努力,一个人一天能提好几百个。



液氮提取啊,收率很高的,而且方便



应该是edwards,另外可以用叶片组织直接pcr的,可以自己摸索,也可以向公司购买。



我是小白来学习下~写写楼上的帮助



上面这位师兄的这篇文献所叙述的方法被广泛应用中,实际操作过程中,个人不建议在提取液中加入ctab,那样可能会导致dna扩增不出来,具体什么原理,暂时也还么有搞懂,但实践证明不加ctab,提取的水稻dna效果很好。并且耗时很短。几千个的话,快的话几天就搞定了。。



请问能说说你的详细步骤吗?是不是和文献上的一样:
用离心管切下叶片,然后用一次性的研磨棒磨碎,加入提取液,漩涡混匀5 s,室温静致1小时。13000 rpm离心1 min,取上清加入适量异丙醇沉淀核酸,13000 rpm离心5 min,干燥沉淀加水溶解。
这两周我在做race,导师单人匹马用传统的ctab法把几千个样都搞掂了....不过再过几个月又要检测晚造的植株了,还是想要试一试简便的方法。


你们导师是一位很强悍的人啊,这点上,让人佩服,作为学生的我们实在是感到汗颜。
上面那位前辈的文献我看了,其实有些步骤是不一样的,比如说我们添加了一步酒精清洗dna,这样的dna比不清洗的肯定要好。
但是师兄不知道你提这个dna干什么用的,有点必须说清楚,sds法提取的是微量dna,如果是做定位什么的,这个方法还是稍显欠缺的。传统ctab法自然是有它的道理。
那么下面就说说一般我们是怎么做的吧。
首先磨碎加入提取液混匀,我们甚至没有用到漩涡震荡仪,静置一段时间,具体我还真没怎么记是多久,反正一个小时以内了,然后12000离心2min,吸取上清,加入异丙醇沉淀,静置两分钟,适量混匀。12000离心5min,去除上清,加入75%酒精清洗,离心5min,去酒精,干燥沉淀,加入ddh2o溶解。



我就是核酸提取后,pcr多态性扩增不出条带(白板),是什么原因呢?用的引物是issr,材料是果树类莲雾叶片,体系没有问题,是让别人一块的带着混样的,模板量是母液稀释30倍后加2微升,提取步骤:ctab法,酚-氯仿-异戊醇抽提10min,氯仿-异戊醇抽提10min, 异丙醇沉淀,te溶解,rna酶处理,氯仿-异戊醇抽提10min, 异丙醇沉淀;dd水溶解===这种情况是年后才出现的,以前的时候没有问题,已经提取了好多次了,有的时候是刚提取后 就扩增条带很好,然后不到一周就又不行了,搞不明白啊~~

十分感谢。我们提dna只是为筛选转基因的水稻植株,dna的质量要求不高。
另再问,你是用液氮磨碎样品的吗?用的提取液应该是和文献的一样的吧:200 mm tris hcl ph 7.5, 250 mm nacl, 25 mm edta, 0.5% sds。




同学你的dna质量如何呢?譬如说扩actin之类的正对照能扩出来么?



正对照是怎么跑的呢?dna质量个人认为还行吧,方法是实验室传统方法,以前都没问题,一直在找原因,头都大了~·




师兄啊我倒是想帮你分析呀,但是我没有实际用ctab操作过,都是理论上的知识,现在也就开始做实验顶天三个月,积淀还差的远,有心无力。
个人觉得吧实际做实验的时候什么情况都能出现。还真说不出来个所以然。有几次我更纠结呢,一个indel引物次p出来了,后面四次一次都没有p出来。模板,引物,pcr条件都试过了,这个到现在都不知道什么原因。
你说有时候刚提取出来的扩增条带很好,不到一周就不行了,是不是dna被降解了?一般来说dan放在4度冰箱是可以保存两个月的。一般溶解dna喜欢用tris ph 8.0 10mm。要不然师兄你试试吧。。。



水稻的话是要而且动作一定要快,液氮的,不然叶片咋个弄的碎哟,提取液用1.5%sds吧。感觉0.5%的话,稍微有点低。


请问一下师姐,要取多少的样呢?可否用液氮磨碎后,再转移到ep管,再加提取液?



首先答案是肯定的,这样子弄可以的撒。
但是为什么要这样做呢?
在液氮磨碎后转移到ep管?你们用研钵磨碎的吗?
还是说你们的样本很难于磨碎,必须使用这样的方式才能磨碎。
一般来说禾本科类的植物取样本的量如水稻只需要3~5分之一叶片就足够了,当然这个也是要根据你做的实验的要求来的。
个人觉得如果做水稻这类禾本科植物的话不需要这么麻烦,这样既浪费液氮,样本的取样量要求也必较大,中间肯定有损失的撒。其他比如木本植物什么的话,可以试试



一般都是酚-氯仿抽提法



我提拟南芥用的!要求不高,pcr就好!



这个提出来,黑乎乎的一坨!明显的不是dna啊!(edtana2 代替了edta)



话说我也是做拟南芥的哇
用这个方法简单方便,很快的
至于为什么会黑乎乎一坨我还真没遇到过?关键是你还用的是坨?
难道不是液体?你提出来是固态?????



不好意思上面这个说法有问题哈,按理来说溶解后的dna应该是无色的吧?



用异丙醇沉淀后,去上清,就是黑乎乎的了!目测是蛋白,加70%乙醇洗2次~ddh2o溶不了!




这个要怎么说好呢
sds这个方法大家运用的都已经很熟悉了
禾本科类的植物用这个方法都很快捷简单
现在来回答生理生态学的这位虫友哈,因为没有名字只能这么称呼了
至于我怎么提取的,具体方法请参照前面回帖,这里就不再说了
提取液的配方请参照前面的用量,次吸取的上清液应该是无色或者绿色的。说是无色的是因为如果你取样特别微量(拟南芥播种后大约20天左右的苗去其叶片)的话,可能是看不到什么东西的,但dna是能提出来的。
如果这步么有问题,那么加入异丙醇沉淀,在管底可能会看到白色的沉淀物的。为啥我又要说可能呢?是因为拟南芥这个东西基因组本来就小,样本再一小,提取出来的量就可能肉眼不见咯。
如果是水稻的话,可以看到很明显的白色沉淀哈~~
如果这样子还在黑乎乎的话,就不知道怎么回事了。。。
只能说求人品。。。。


我们有植物直接pcr试剂盒,无需单独提取dna,快速、灵敏、特异性强,适用于植物样品的高通量筛选和检测。qq:



请问你在析出dna那一步,加入-20度无水乙醇后放在-20度冰箱中多久啊。放久了会不会对dna有影响啊。



水稻直接丁丁点叶片,想办法捣烂巴点,加naoh95度煮煮数分钟,加点酸中和,上清液就可以去做pcr了





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