原核生物的转录终止有两种形式,一种是依赖ρ(rho)因子的终止,一种是不依赖ρ因子的终止。原核生物dna没有共有的终止序列,而是转录产物序列指导终止过程。转录终止信号存在于rna产物3’端而不是在dna模板。
1、依赖ρ因子的转录终止
rho因子是rho基因的产物,广泛存在于原核和真核细胞中,由6个亚基组成,分子量300kd。rho因子结合在新生的rna链上,借助水解atp获得能量推动其沿着rna链移动,但移动速度比rna聚合酶慢,当rna聚合酶遇到终止子时便发生暂停,rho因子得以赶上酶。rho因子与rna聚合酶相互作用,导致释放rna,并使rna聚合酶与该因子一起从dna上释放下来。
2.不依赖ρ因子的转录终止
这种转录终止方式是由于在dna模板上靠近终止处有些特殊的碱基序列,即较密集的a-t配对区或g-c配对区,这一部位转录出的rna产物3’端终止区一级结构有7~20碱基的反向重复序列,能形成具有茎和环的发夹结构,发夹结构3’侧7~9碱基后有4~6个连续的u。rna转录的终止即发生在此二级结构之内或之后。当新生成的rna链3’端出现发夹样局部二级结构时,rna聚合酶就会停止作用,这可能是此二级结构改变了rna聚合酶的构象,使酶不再向下游移动,磷酸二酯键停止形成,rna合成终止。因此转录终止信号仍是rna产物序列。在发夹结构后的连续u使rna-dna杂交链含多个u-a碱基配对而不稳定,容易解离,转录实际终止点在连续u末端的某一位点。局部解开的dna恢复双螺旋,核心酶从模板上释放出来。
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