当ThruPLEX技术遇上FFPE样本,会带来怎样的“*操作”!

formalin fixed and paraffin embedded
ffpe样本作为生物和医学领域的重要样本来源,广受研究者的青睐。由于样本固定和储存过程中,容易发生核酸的降解和损伤,因此获得符合测序质量要求的文库通常很具有挑战性。那么面对做dna-seq的ffpe样本,应该如何应对呢?
“想要随心所欲的进行ffpe-dna样本文库构建”,
这个神器值得拥有

【smarter thruplex dna-seq kit】
“飞一般感觉”的操作
ffpe样本珍贵,担心在文库制备时损失?选择它吧。
该试剂盒利用thruplex技术,通过使用特殊的茎环形接头,实现了更加简洁高效的实验流程和更短时间的手动操作。从起始dna样本到可用于上机测序的文库仅需要三步2小时的操作。特别需要说明的是,整个操作是在一个反应管中即可完成,中间不需要纯化,能很大程度的减少样本的污染和损失!
技术概要:
(图片来源于takara bio inc.)
“*”的文库质量
ffpe样本降解严重,害怕不能得到高质量文库?选择它吧。
takara严谨的数据评测:使用100 ng的ffpe-dna样品,分别使用本试剂盒、a公司试剂盒和b公司试剂盒制备文库,然后使用illumina nextseq 500(2×76bp)测序分析。相比于其他公司试剂盒,以ffpe样品起始时,使用本试剂盒可以获得多样性更好的文库。另外,使用本试剂盒制备的文库,在不同gc含量范围内可以产生更均匀的覆盖分布。
(数据来源于takara bio inc.)
“经得起检验”-文献引用加持
说得好不如做得好,应用文献的真实反馈可供参考,选择它吧。
2018年7月20日发表在《npj genomic medicine》题为recurrent loss of heterozygosity correlates with clinical outcome in pancreatic neuroendocrine cancer的文章。本研究利用全基因组测序技术(wgs)分析了胰腺神经内分泌瘤的拷贝数变异情况,结果表明,胰腺神经内分泌肿瘤的染色体杂合性的缺失与临床预后相关。实验以3-50 ng的微量ffpe-dna样本起始,使用thruplex-fd kit(现为thruplex dna-seq kit)制备文库,并通过wgs与微阵列结果来验证拷贝数变异(cnv)。
以上内容都佐证了以降解样本起始时,使用该试剂盒可以得到高品质的文库!
所以,恰好您要用ffpe样本进行基因组分析,恰好我有smarterthruplex dna-seq kit。世间好物虽多,但它值得尝试!
重庆市华雅干细胞技术有限公司拥有takara*clontech品牌代理,*现货,欢迎咨询!

过氧化氢终末消毒机,医院终末消毒过氧化氢技术
纯水的应用
无锡市人大常委会主任徐一平、无锡市副市长高亚光一行*莅临汉和指导工作
截止阀适用场合与选用原则
激光清洗在模具行业的应用
当ThruPLEX技术遇上FFPE样本,会带来怎样的“*操作”!
全启式弹簧安全阀应该如何正确安装
德源环保详解化学沉淀法
行车式刮泥机技术说明
汽车铜导线超声波金属焊接机的常见误区
皮革废水处理-废水治理工艺流程
干燥空气发生器如何选型?
聚氨酯预制直埋保温管道管沟土方挖掘及施工
气动高压截止阀的工作原理详解
顶层设计加速国家水网建设 水利监测仪器领域有望受益
我们应该怎样正确使用防爆冰箱呢?
蔬菜储存有期限,储存超时有风险!
制药纯化水设备产水量变化的原因分析
举例说明BURKERT流量计原理分析
支原体检查的药典补充方法